Stasiun pengisian bahan bakar kontainer terutama beroperasi melalui jalan darat, kereta api, dan laut. Transportasi jalan raya fleksibel dan nyaman, cocok untuk jarak pendek dan medan yang rumit, sehingga seluruh peralatan harus diantar ke tujuannya melalui trailer khusus. Transportasi kereta api cocok untuk transportasi antarwilayah-jarak jauh, sehingga peralatan harus diamankan di truk bak datar khusus untuk memastikan pengoperasian yang aman. Transportasi laut terutama digunakan untuk transportasi internasional atau antarbenua, menggunakan kontainer standar untuk-perjalanan jarak jauh. Terlepas dari moda transportasi, peralatan harus diperkuat untuk mencegah getaran dan tabrakan selama transportasi, sekaligus memastikan kepatuhan terhadap peraturan transportasi dan persyaratan keselamatan yang relevan.
